Eine Forschungsgruppe, die unter anderem aus dem Androiden David, Elizabeth Shaw und Peter Weyland besteht, geht mit dem Raumschiff Prometheus im späten 21. Jahrhundert auf Suche, um Hinweise auf die Ursprünge des menschlichen Lebens zu finden. Dabei werden sie auf einer gefährlichen Reise zu den dunkelsten Winkeln des Universums geführt und müssen sich dort einem schrecklichen Kampf stellen, um die Zukunft der Menschheit zu sichern.
