In naher Zukunft ist unsere Welt nahezu komplett zerstört. Die Menschheit muss seitdem über den Wolken leben, um sich vor blutrünstigen Aliens zu retten, die die letzten Trümmer der Erde belauern. Der Spezialtechniker Jack (Tom Cruise) ist als einer der wenigen Menschen auf der Erde stationiert ist. Doch seine Jahre andauernde Mission, lebenswichtige Ressourcen zu sammeln, geht dem Ende zu und so darf er wieder in das Wolkenreich der Menschen zurück. Kurz vor Abflug entdeckt er auf einem Routine-Flug ein abgestürztes Raumschiff neben dem er eine Überlebende findet. ?Liegen lassen? lautet die Order von ganz oben, doch Jack widersetzt sich dieser Anweisung und will die junge Frau retten. Das bringt den Stein ins Rollen und Jack wird zum Gejagten. All diese mysteriösen Ereignisse bringen ihn auf eine neue, ungeahnte Fährte, die ein dunkles Geheimnis zu beherbergen scheint.
