Animationsfilm über einen Jedermann, dessen Leben durch einen Geist mächtig durcheinander gewirbelt wird.
Im fernen Japan längst vergangener Zeit lebt der junge Kubo in einem Dorf mit seiner Mutter. Sein Vater war einst ein legendärer Samuraikrieger, Um der kranken Mutter zu helfen, erzählt Kubo in der Dorfgemeinschaft spannende Geschichten von Monstern und Göttern. Aus Versehen erweckt er dabei einen Geist aus längst vergangener Zeit, der eine alte blutige Vergeltungsaktion am legendären Samuraikrieger und seinen Erben – sprich Kubo – zu begleichen hat. Im Chaos gelingt Kubo die Flucht, doch die Probleme fangen erst an. Unwissend über die Geheimnisse seines verstorbenen Vaters, seinen magischen Fähigkeiten und wie er den rachsüchtigen Moon King und seine Schwester besiegen soll, begibt er sich auf seine Reisen, unterstützt von Monkey und Beetle.